发烧咳嗽时首先要寻找病因，可以检查血常规、血沉、C-反应蛋白及胸部X线，如果是病毒性引起的咳嗽发烧，可以使用抗病毒药物对症治疗。如果是细菌感染引起的咳嗽发烧，可以使用抗生素药物对症治疗，如青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类及喹诺酮类，但喹诺酮类药物不适合18周岁以下的青少年使用。可以配合中成药，如急支糖浆、蜜炼川贝枇杷膏、强力枇杷露、肺力咳合剂等清热化痰药物。
若是考虑肺结核引起的发低热、咳嗽等症状，建议检查痰培养、痰中找结核杆菌、胸部CT等。对明确诊断为肺结核的患者，建议到正规的专科医院诊治，一般给予抗结核药物对症治疗。如果考虑肺癌引起的咳嗽、发烧症状，有手术指征者，建议尽早手术治疗，无手术指征者建议放化疗。
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