医生一般会行肠镜检查等，根据结果行相关治疗普外科主要是针对如阑尾炎，或者肠道内长有肿物，需要行手术治疗等疾病肿瘤科一般是针对已经明确肠道内长有肿瘤，或者是肿瘤术后化疗及复诊等疾病。如果肠道疾病是属于良性的肿瘤，包括息肉病，则也是需要就诊消化内科，需要行电子肠镜下息肉电凝电切除术，具体的需要咨询专科医生。肠道疾病挂肛肠科，还可以去消化内科，通过肠镜检查，肠道内是否患有疾病，肠炎或者是肠道内有肿瘤，都会导致肠道菌群失调，或者是大便不成形，颜色发黑等症状。
十二指肠溃疡以良性溃疡最多，因幽门螺杆菌感染，口服阿司匹林、氯吡格雷、激素等药物，进食辛辣刺激食物、大量的饮酒、吸烟、精神紧张等各种诱因导致十二指肠溃疡发生，主要表现上腹部疼痛、腹胀、夜间痛，空腹痛比较明显，会伴有恶心、呕吐、食欲减退等表现。因此，对于溃疡性结肠炎，应积极治疗控制病情，目前的治疗可使用5-氨基水杨酸类制剂，例如柳氮磺吡啶、奥沙拉秦、美沙拉嗪。十二指肠溃疡是属于慢性的疾病，是否严重要根据是否合并有并发症以及是否反复出现不适症状而评估。
对于腹痛严重，上述治疗无效患者，且精神症状明显者可给予抗抑郁的药物，最后应给予肠道微生态制剂，例如双歧杆菌、乳酸杆菌、乳酸菌等，可以纠正肠道菌群失调，对于腹泻、腹胀有一定的疗效。肠道出现紊乱最常见的药物是服用益生菌类药物，可以调节肠道内的菌群，帮助肠道得到一个很好的恢复，常用的益生菌类药物有金双歧、整肠生、双歧杆菌三联活菌胶囊。肠道失调可以吃吗丁啉、谷维素、蒙脱石散、乳果糖等药物治疗。
