阿莫西林克拉维酸钾和头孢是两种药物，可以分别治疗不同的病原菌感染，所以无法单纯判断二者哪个效果好。对于革兰阳性菌以及厌氧菌，阿莫西林克拉维酸钾的抗菌效果较好，而头孢种类较多，针对的病原菌也比较广。
阿莫西林克拉维酸钾属于青霉素类抗生素，而头孢属于头孢菌素类抗生素，上述两类药物都归属为β-内酰胺类抗生素，作用机制有一定的相似性，但是抗菌谱、抗菌作用的强度等各方面又有一定的差异。因此，对不同病菌感染，上述抗生素有着各自的优势与劣势，只有结合具体的病原菌用药才比较正确，而不能一概而论哪个效果好。而头孢种类繁多，其中一代和二代头孢偏向于革兰阳性球菌感染，而三代头孢、四代头孢偏向于革兰阴性杆菌感染，所以建议遵医嘱选用更为合适的药物。
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