胎儿唇裂可能由遗传因素、营养缺乏、药物影响、病毒感染、环境毒素等原因引起。
家族中有唇裂病史的孕妇，胎儿发生唇裂的风险显著增加。特定基因如IRF6、MSX1的突变与唇腭裂发育异常相关。近亲婚配或父母携带隐性基因时，胚胎颌面部融合过程易出现障碍。
妊娠早期叶酸摄入不足会干扰神经嵴细胞迁移，导致上颌突与内侧鼻突融合失败。维生素B6、B12及锌元素缺乏同样可能影响胚胎面部发育，建议孕前3个月开始每日补充400微克叶酸。
抗癫痫药如苯妥英钠、丙戊酸钠可能干扰细胞分化过程。皮质类固醇、部分化疗药物及过量维生素A超过10000IU/日也会增加风险，妊娠期用药需严格遵循产科医生指导。
风疹病毒、巨细胞病毒感染可能破坏胚胎颌面部血管形成。病毒与母体发热反应共同作用时，会阻碍妊娠6-10周关键期的组织融合，孕前接种疫苗可降低此类风险。
孕期接触有机溶剂、农药或重金属可能干扰细胞信号传导。吸烟孕妇胎儿唇裂发生率是非吸烟者的1.7倍，酒精摄入量每日超过20克会使风险提升3倍。
预防胎儿唇裂需从孕前开始综合干预，包括遗传咨询、均衡摄入绿叶蔬菜与动物肝脏等富含叶酸食物，避免接触X射线与二手烟，保持适度运动如孕妇瑜伽或散步以增强体质。妊娠期定期超声检查可早期发现发育异常，确诊后可通过新生儿唇裂修复手术改善外观与功能。
