板蓝清热颗粒不宜与解热镇痛药、抗生素、抗凝药、免疫抑制剂及含金属离子药物联用，可能降低药效或增加不良反应风险。
板蓝根具有轻微退热作用，与对乙酰氨基酚、布洛芬等解热镇痛药联用可能导致体温过低。两类药物均通过肝脏代谢，长期合用可能加重肝脏负担，出现恶心、食欲减退等消化道症状。
板蓝根中的绿原酸成分可能降低阿莫西林、头孢克肟等β-内酰胺类抗生素的抗菌活性。与环丙沙星等喹诺酮类抗生素联用时，其中的金属离子螯合作用可能影响药物吸收率。
板蓝根含有的多糖成分可能增强华法林、利伐沙班的抗凝效果，增加皮下瘀斑、牙龈出血等出血风险。术前两周应避免合用，需监测凝血酶原时间国际标准化比值。
板蓝根的免疫调节作用可能干扰环孢素、他克莫司等钙调磷酸酶抑制剂的药效，导致移植排斥反应风险升高。器官移植患者需间隔4小时以上服用，定期检测血药浓度。
板蓝根中的有机酸与硫酸亚铁、葡萄糖酸锌等金属离子药物结合会形成难溶性复合物，影响铁剂、锌剂的肠道吸收。建议间隔2小时服用，贫血患者需监测血红蛋白水平。
服用板蓝清热颗粒期间应避免饮酒及辛辣食物，体质虚寒者慎用。出现皮疹、呼吸困难等过敏反应需立即停药。建议服药后适当增加饮水量促进代谢，服药间隔需遵医嘱。慢性病患者联合用药前应咨询医师，定期复查肝肾功能指标。
