单纯性肾囊肿通常无明显症状，部分患者可能出现腰部钝痛、血尿、腹部包块、高血压及尿路感染等表现。
囊肿增大压迫肾包膜或周围组织时，可能引发单侧腰部持续性隐痛或胀痛，活动后可能加重。疼痛通常局限在患侧，无放射感。日常可通过热敷或调整体位缓解，若疼痛剧烈需就医排除囊肿破裂或出血。
囊肿壁血管破裂可能导致间歇性无痛性血尿，尿液呈洗肉水样或酱油色。血尿程度与囊肿位置有关，靠近集合系统的囊肿更易出血。出现血尿时应避免剧烈运动，及时进行尿常规和影像学检查。
巨大囊肿直径＞5cm可在腹部触诊时扪及光滑囊性肿物，多位于肋缘下或侧腹部。包块随呼吸移动，按压有弹性感。体检发现包块需通过超声或CT明确性质，避免误诊为肿瘤。
囊肿压迫肾实质可能导致肾素-血管紧张素系统激活，引发血压升高。此类高血压多为难治性，收缩压和舒张压同步上升。控制血压可选用缬沙坦、氨氯地平等药物，同时监测肾功能变化。
囊肿合并感染时会出现发热、尿频、尿急等症状，尿液检查可见白细胞和细菌。致病菌多为大肠埃希菌，治疗需根据药敏结果选用左氧氟沙星、头孢呋辛等抗生素，感染控制后建议手术引流。
单纯性肾囊肿患者日常需限制高嘌呤饮食，避免动物内脏和酒精摄入；适度进行快走、游泳等低冲击运动；每6-12个月复查超声监测囊肿变化。若出现持续腰痛、反复血尿或肾功能异常，需考虑超声引导下穿刺抽液或腹腔镜囊肿去顶术等治疗。
