甲状腺乳头状癌的预后相对较好，10年生存率可达90%以上，具体生存期与肿瘤分期、治疗时机及个体差异密切相关。
肿瘤大小、是否转移和年龄是影响预后的关键因素。直径小于2厘米且未突破包膜的肿瘤T1期治愈率超过95%，而出现淋巴结转移N1期或远处转移M1期时生存率会下降。年轻患者＜55岁的预后显著优于高龄群体。
手术切除是核心治疗手段，包括甲状腺全切术和中央区淋巴结清扫术。术后根据情况辅以放射性碘131治疗，针对无法手术的病灶可考虑靶向药物乐伐替尼、索拉非尼或安罗替尼。
术后需定期检测甲状腺球蛋白和颈部超声。局部复发可通过再次手术控制，远处转移灶多采用放射性碘治疗。五年内复发率约15%，但二次治疗后仍可获得长期生存。
术后甲状腺功能减退需终身服用优甲乐替代治疗。规范用药下患者可正常工作和生育，但需避免过度疲劳。声音嘶哑、低钙血症等手术并发症多数可在6个月内恢复。
高细胞型、柱状细胞型等侵袭性亚型预后较差，需更积极的治疗。BRAF V600E基因突变患者复发风险较高，建议加强随访密度至每3个月一次。
患者应保持低碘饮食，避免海带紫菜等富碘食物，规律进行快走、游泳等有氧运动。术后每3-6个月复查甲状腺功能及颈部超声，出现声嘶、骨痛等症状需及时就诊。心理支持对缓解治疗焦虑具有重要价值，可参与专业患者互助团体。
