百日咳与过敏性咳嗽可从病原体、症状特征、病程、诊断方法和治疗手段五个方面进行区分。
1、病原体差异：百日咳由百日咳鲍特菌感染引起，具有强传染性；过敏性咳嗽则因接触过敏原如尘螨、花粉导致气道高反应性，无传染性。前者需抗生素治疗如阿奇霉素、克拉霉素，后者以抗组胺药如氯雷他定和吸入激素为主。
2、症状特征：百日咳典型表现为阵发性痉挛性咳嗽伴鸡鸣样回声，夜间加重；过敏性咳嗽多为持续性干咳，常伴鼻痒、打喷嚏。百日咳咳嗽后可能出现呕吐，过敏性咳嗽少见该症状。
3、病程区别：百日咳病程分卡他期、痉咳期和恢复期，持续2-3个月；过敏性咳嗽呈发作性，脱离过敏原后缓解，病程不定。百日咳愈后获持久免疫，过敏性咳嗽易反复发作。
4、诊断方法：百日咳通过鼻咽拭子PCR检测或细菌培养确诊；过敏性咳嗽需结合过敏原皮试、血清IgE检测及病史综合判断。两者胸片表现不同，百日咳可见"三角征"，过敏性咳嗽多无异常。
5、治疗手段：百日咳需早期使用大环内酯类抗生素，重症需住院氧疗；过敏性咳嗽需避免过敏原，使用孟鲁司特钠或布地奈德雾化。百日咳患者需隔离，过敏性咳嗽需环境控制。
预防百日咳应接种百白破疫苗，过敏性咳嗽患者需保持室内清洁、使用空气净化器。饮食上避免辛辣刺激食物，百日咳患者可食用蜂蜜缓解咳嗽，过敏性咳嗽需规避已知过敏食物。适度有氧运动增强免疫力，但过敏季节减少户外活动。
