保持器可通过浸泡清洁、机械刷洗、超声波清洗、专用清洁片、定期深度消毒等方式清洁。
使用温水或假牙清洁液浸泡保持器5-10分钟，水温不超过40℃以避免变形。浸泡能软化牙菌斑和食物残渣，适合每日早餐后使用。避免使用含酒精或漂白剂的溶液，可能腐蚀树脂材质。
选用软毛牙刷蘸取中性肥皂轻刷保持器内外表面，重点清洁卡槽和边缘处。刷牙力度需轻柔，防止刮花表面形成菌斑附着点。建议每日睡前配合浸泡同步进行，避免使用牙膏研磨剂。
每周2-3次使用家用超声波清洗机，通过高频震荡去除微观污渍。选择专用清洁剂配合3-5分钟清洗周期，对隐形保持器关节缝隙清洁效果显著。清洗后需用清水彻底冲洗残留化学物质。
采用含过碳酸钠的保持器清洁片溶解于温水，浸泡15分钟分解蛋白质沉积。这类氧化类清洁剂能杀灭白色念珠菌等常见微生物，每月使用不超过8次以防材质老化。
每两周使用稀释的假牙消毒液如聚维酮碘溶液浸泡30分钟，杀灭顽固微生物。消毒后需用流动水冲洗2分钟以上，避免化学残留刺激口腔黏膜。旅行时可改用独立包装的消毒湿巾临时处理。
保持器清洁需配合日常护理，晨起后清水冲洗去除夜间沉积物，进食前取下存放于专用透气盒。避免高温暴晒或酒精擦拭，选择含维生素E的保持器保湿喷雾可延缓材质氧化。运动后及时清洁汗液盐分，游泳时建议使用防水存储盒。每半年使用专业抛光膏处理表面划痕，定期口腔检查时携带保持器评估清洁状况。
