胎儿食道闭锁可能由遗传因素、环境致畸物暴露、胚胎发育异常、血管异常、染色体异常等原因引起。
部分胎儿食道闭锁病例与家族遗传倾向相关。某些基因突变可能干扰胚胎期前肠分化过程，导致食道与气管分离异常。这类情况多伴随其他先天性畸形，需通过基因检测确认。
妊娠早期接触酒精、香烟、抗癫痫药物等致畸物质可能破坏食道发育。这些物质通过干扰细胞迁移和管腔形成过程，造成食道中段或远端闭锁，常合并心脏或肛门直肠畸形。
胚胎第4-6周前肠分化障碍是主要机制。气管食管隔发育不全导致两者未能完全分离，形成盲端型闭锁。此类情况多表现为Ⅲ型食道闭锁，占临床病例70%以上。
食道局部缺血与血管发育缺陷相关。胚胎期食道血供不足可能导致局部组织坏死吸收，形成闭锁段。这种情况常伴随食管气管瘘，需通过超声检查评估血管走行。
18三体综合征、21三体综合征等染色体疾病可能干扰食道形成。这类病例多合并多发畸形，产前超声可见羊水过多、胃泡消失等特征性表现，需进行羊水穿刺确诊。
孕妇应保证均衡营养摄入，重点补充叶酸和维生素B族以降低畸形风险。避免接触辐射源和化学污染物，定期进行产前超声筛查。妊娠期适当进行低强度有氧运动如散步、孕妇瑜伽，有助于改善胎盘血流。发现异常需及时转诊至胎儿医学中心进行多学科评估，出生后需新生儿外科团队实施食道重建手术。
