HPV疫苗二价、四价、九价的主要区别在于预防病毒型别数量和覆盖范围，二价针对HPV16/18型，四价增加HPV6/11型，九价进一步覆盖HPV31/33/45/52/58型。
二价疫苗预防HPV16和18型，这两种高危型别导致70%宫颈癌。四价疫苗在二价基础上增加HPV6和11型，可预防90%生殖器疣。九价疫苗覆盖7种高危型16/18/31/33/45/52/58和2种低危型6/11，预防范围扩大至92%宫颈癌及90%生殖器疣。
二价疫苗国内批准接种年龄为9-45岁女性，四价为20-45岁女性，九价为16-26岁女性。不同国家批准年龄存在差异，如九价疫苗在美国获批用于9-45岁男女。年龄限制主要基于临床试验数据，超龄接种需咨询医生评估。
三种疫苗均需接种3剂，但时间安排不同。二价采用0-1-6月程序，四价和九价采用0-2-6月程序。15岁以下儿童可接种2剂，间隔6-12个月。免疫功能低下者仍需完成3剂接种程序。
二价疫苗对HPV16/18相关癌前病变保护率达93%，四价疫苗对宫颈上皮内瘤变保护效力为98%，九价疫苗对HPV31/33/45/52/58型相关病变保护率为97%。所有疫苗在完成接种后10年内无需加强免疫。
优先选择覆盖型别多的疫苗，九价为首选。若无法获取九价，二价和四价仍能有效预防主要高危型HPV。男性接种可选用四价或九价疫苗以预防肛门癌和生殖器疣。已接种低价次疫苗者，不建议重复接种高价次疫苗。
接种HPV疫苗需结合年龄、性别、疫苗可及性综合选择，同时需定期进行宫颈癌筛查。饮食上建议补充富含维生素A、C、E的食物如胡萝卜、柑橘、坚果，适度运动增强免疫力，接种后24小时内避免剧烈运动，注射部位保持清洁干燥。疫苗不能替代常规妇科检查，有性生活的女性仍需每3年进行宫颈细胞学检测。
