保济丸的注意事项包括用药禁忌、特殊人群限制、药物相互作用、不良反应监测及储存条件等。
对保济丸成分过敏者禁用，主要成分广藿香、苍术、厚朴可能引发皮疹或呼吸困难。风寒感冒伴发热患者不宜使用，其解表化湿功效可能加重病情。急性胃肠炎伴严重脱水时需优先补液治疗，避免单纯依赖中成药延误救治。
孕妇需在中医师指导下使用，方中木香、白芷等活血行气药可能影响妊娠。哺乳期妇女服药期间建议暂停哺乳，药物成分可能通过乳汁分泌。儿童用药需按体重减量，6岁以下每日剂量不超过成人1/3，避免胃肠刺激。
与抗生素联用可能降低疗效，保济丸的吸附作用影响诺氟沙星、左氧氟沙星吸收。服用降糖药期间需监测血糖，苍术提取物可能增强格列本脲作用。避免与含鞣质的中药同服，可能形成复合物影响药效。
常见恶心腹胀等胃肠反应，多出现于空腹服药时。偶见皮肤瘙痒需立即停用，可能提示过敏反应。长期超量服用可能导致肝酶升高，建议连续使用不超过7天，症状未缓解应就医。
铝塑包装需避光保存于30℃以下环境，高温易致丸剂粘连变质。开封后需密封防潮，湿度超过70%可能滋生霉菌。注意查看药丸颜色变化，正常为棕褐色，若出现黑斑或异味应丢弃。
服用保济丸期间建议清淡饮食，避免辛辣油腻食物加重胃肠负担，可配合山药粥调理脾胃。用药后适当散步促进药物吸收，但避免剧烈运动诱发呕吐。储存时放置于儿童无法触及的阴凉干燥处，定期检查有效期，过期药物需专业机构回收处理。出现持续腹痛或排便异常应及时就医排查肠梗阻等并发症，慢性疾病患者用药前应咨询医师评估基础病情况。
