百令胶囊需避免与免疫抑制剂、抗凝血药物、降糖药、强效利尿剂及含重金属药物联用，可能引发药物相互作用或加重不良反应。
百令胶囊具有免疫调节作用，与环孢素、他克莫司、硫唑嘌呤等免疫抑制剂联用可能导致过度免疫抑制。两类药物协同作用可能增加感染风险，或影响器官移植患者的排斥反应控制。使用期间需监测淋巴细胞亚群及炎症指标。
华法林、利伐沙班、达比加群酯等抗凝药与百令胶囊存在潜在相互作用。虫草素成分可能影响血小板聚集，增加出血风险。联合用药时应定期检测凝血酶原时间PT和国际标准化比值INR，观察皮下瘀斑、鼻出血等出血倾向。
与胰岛素、格列本脲、二甲双胍联用需警惕低血糖风险。百令胶囊中多糖成分可能增强降糖效果，导致血糖波动。糖尿病患者联合用药时应加强血糖监测，调整降糖方案需在内分泌科医师指导下进行。
呋塞米、托拉塞米等利尿剂可能加速虫草有效成分排泄，降低药效。长期联用可能导致电解质紊乱，表现为低钾血症、肌无力等症状。建议间隔2小时以上服用，定期复查血钾、血钠水平。
雄黄、朱砂等含砷、汞成分的中成药与百令胶囊联用可能加重肝肾负担。重金属与虫草蛋白结合可能产生毒性复合物，出现恶心、蛋白尿等中毒症状。用药期间需监测肝肾功能，避免同类药物叠加使用。
服用百令胶囊期间建议保持低盐低脂饮食，适量食用山药、百合等健脾食材；避免剧烈运动导致大量出汗影响药物代谢；用药2周后应复查肝肾功能，出现皮疹、心悸等不适立即停药就诊。慢性病患者联合用药前需提供完整用药清单供医师评估。
